記者2023年12月29日從蘭州大學獲悉，該校反芻動物研究所王維民教授團隊發(fā)布了國內首款基于大規(guī)模基因組選擇參考群的高性能綿羊基因組育種芯片“蘭大·華羊芯”。這是該團隊組織實施的“綿羊雙萬羊基因組計劃”第一階段的成果。
為提升我國綿羊基因組育種技術水平，王維民團隊通過持續(xù)精準的大規(guī)模性能測定與基因組重測序，率先在國內構建規(guī)模達10318只、羊只來源覆蓋全國8家國家湖羊核心育種場和4家規(guī)模化湖羊種羊場的基因組選擇參考群，累計獲得了80萬條表型數(shù)據(jù)和78TB的基因組數(shù)據(jù)。研究團隊繪制出包含2000萬個高質量遺傳變異位點超高分辨率的湖羊基因組遺傳變異圖譜，鑒定出飼料轉化率、生長速度、尾脂重、肌內脂肪等一系列湖羊重要經(jīng)濟性狀的關鍵基因。
此后，研究團隊聯(lián)合石家莊博瑞迪生物技術有限公司，利用大數(shù)據(jù)、生物信息學、育種學等相關技術，研發(fā)出包含45052個具有代表性、全局性、功能性位點的高性能45K基因組育種芯片“蘭大·華羊芯”，并衍生出可在不同應用場景下靈活使用的10K低密度和1K超低密度兩款配套使用的系列育種芯片。“芯片配套的遺傳評估技術，可用于湖羊基因組選擇育種、重要經(jīng)濟性狀基因定位、品種鑒定、家系劃分、系譜校正等。”王維民介紹。
據(jù)了解，“蘭大·華羊芯”的設計和遺傳評估技術已經(jīng)過業(yè)內專家反復論證，并在天津奧群牧業(yè)有限公司、甘肅潤牧生物工程有限公司等有關企業(yè)進行了近萬只羊的驗證。結果顯示，該育種芯片在重要經(jīng)濟性狀的選種準確性上已經(jīng)可以比肩國際同類產(chǎn)品，尤其是在我國綿羊育種技術領域最具潛力的突破性性狀飼料轉化率的基因組預測方面，填補了全球綿羊基因組選擇育種技術的空白。